MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 168 chromosome

Total Repeats: 25441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017509	CAAA	2	8	4	11	75 %	0 %	0 %	25 %	385334156
2	NC_017509	AAT	2	6	16	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334156
3	NC_017509	CAA	2	6	49	54	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334156
4	NC_017509	TTA	2	6	64	69	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334156
5	NC_017509	TGT	2	6	80	85	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334156
6	NC_017509	AAC	2	6	88	93	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334156
7	NC_017509	T	6	6	94	99	0 %	100 %	0 %	0 %	385334156
8	NC_017509	ATT	2	6	136	141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334156
9	NC_017509	AAT	2	6	256	261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334156
10	NC_017509	AAAG	2	8	277	284	75 %	0 %	25 %	0 %	385334156
11	NC_017509	A	6	6	300	305	100 %	0 %	0 %	0 %	385334156
12	NC_017509	TTA	2	6	482	487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334156
13	NC_017509	AGA	2	6	518	523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334156
14	NC_017509	TTC	2	6	564	569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385334156
15	NC_017509	A	6	6	593	598	100 %	0 %	0 %	0 %	385334156
16	NC_017509	CTTTT	2	10	635	644	0 %	80 %	0 %	20 %	385334156
17	NC_017509	TGA	2	6	645	650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334156
18	NC_017509	AACA	2	8	667	674	75 %	0 %	0 %	25 %	385334156
19	NC_017509	TTG	2	6	686	691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334156
20	NC_017509	ATA	2	6	736	741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334156
21	NC_017509	CTT	2	6	758	763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385334156
22	NC_017509	TGG	2	6	768	773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334156
23	NC_017509	GAA	2	6	778	783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334156
24	NC_017509	ATTAA	2	10	817	826	60 %	40 %	0 %	0 %	385334156
25	NC_017509	A	6	6	835	840	100 %	0 %	0 %	0 %	385334156
26	NC_017509	GAA	2	6	877	882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334156
27	NC_017509	ATG	2	6	908	913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334156
28	NC_017509	ATTCG	2	10	944	953	20 %	40 %	20 %	20 %	385334156
29	NC_017509	T	6	6	983	988	0 %	100 %	0 %	0 %	385334156
30	NC_017509	CAAA	2	8	994	1001	75 %	0 %	0 %	25 %	385334156
31	NC_017509	AAAT	2	8	1005	1012	75 %	25 %	0 %	0 %	385334156
32	NC_017509	ATTT	2	8	1024	1031	25 %	75 %	0 %	0 %	385334156
33	NC_017509	A	7	7	1039	1045	100 %	0 %	0 %	0 %	385334156
34	NC_017509	TTG	2	6	1058	1063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334156
35	NC_017509	AACA	2	8	1079	1086	75 %	0 %	0 %	25 %	385334156
36	NC_017509	A	6	6	1157	1162	100 %	0 %	0 %	0 %	385334156
37	NC_017509	ATTA	2	8	1203	1210	50 %	50 %	0 %	0 %	385334156
38	NC_017509	ATA	2	6	1232	1237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334156
39	NC_017509	T	7	7	1248	1254	0 %	100 %	0 %	0 %	385334156
40	NC_017509	AAC	2	6	1255	1260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334156
41	NC_017509	AAT	2	6	1275	1280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334156
42	NC_017509	A	7	7	1291	1297	100 %	0 %	0 %	0 %	385334156
43	NC_017509	CAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334156
44	NC_017509	AAAATA	2	12	1386	1397	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385334156
45	NC_017509	T	6	6	1447	1452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017509	TTA	2	6	1469	1474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017509	ATT	2	6	1480	1485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017509	TAAA	2	8	1491	1498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017509	ATATA	2	10	1509	1518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017509	ATT	2	6	1519	1524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017509	A	9	9	1553	1561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017509	ATA	2	6	1604	1609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334157
53	NC_017509	T	8	8	1630	1637	0 %	100 %	0 %	0 %	385334157
54	NC_017509	AAG	2	6	1647	1652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334157
55	NC_017509	ATT	2	6	1656	1661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334157
56	NC_017509	CAA	2	6	1670	1675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334157
57	NC_017509	A	6	6	1708	1713	100 %	0 %	0 %	0 %	385334157
58	NC_017509	ATG	2	6	1730	1735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334157
59	NC_017509	T	7	7	1760	1766	0 %	100 %	0 %	0 %	385334157
60	NC_017509	TTA	2	6	1775	1780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334157
61	NC_017509	T	6	6	1832	1837	0 %	100 %	0 %	0 %	385334157
62	NC_017509	T	6	6	1850	1855	0 %	100 %	0 %	0 %	385334157
63	NC_017509	TTC	2	6	1872	1877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385334157
64	NC_017509	T	7	7	1878	1884	0 %	100 %	0 %	0 %	385334157
65	NC_017509	AATTA	2	10	1911	1920	60 %	40 %	0 %	0 %	385334157
66	NC_017509	A	6	6	1953	1958	100 %	0 %	0 %	0 %	385334157
67	NC_017509	CAA	3	9	1970	1978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334157
68	NC_017509	A	6	6	2075	2080	100 %	0 %	0 %	0 %	385334157
69	NC_017509	AATA	2	8	2103	2110	75 %	25 %	0 %	0 %	385334157
70	NC_017509	CAA	2	6	2307	2312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334157
71	NC_017509	TGAT	2	8	2330	2337	25 %	50 %	25 %	0 %	385334157
72	NC_017509	ACA	2	6	2341	2346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334157
73	NC_017509	TTA	2	6	2372	2377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334157
74	NC_017509	A	6	6	2391	2396	100 %	0 %	0 %	0 %	385334157
75	NC_017509	A	6	6	2451	2456	100 %	0 %	0 %	0 %	385334157
76	NC_017509	TTCGA	2	10	2498	2507	20 %	40 %	20 %	20 %	385334157
77	NC_017509	A	6	6	2597	2602	100 %	0 %	0 %	0 %	385334157
78	NC_017509	T	8	8	2696	2703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017509	A	8	8	2715	2722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017509	A	7	7	2746	2752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017509	A	7	7	2782	2788	100 %	0 %	0 %	0 %	385334158
82	NC_017509	TTG	2	6	2820	2825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334158
83	NC_017509	GGC	2	6	2831	2836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334158
84	NC_017509	ATT	2	6	2863	2868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334158
85	NC_017509	A	9	9	2869	2877	100 %	0 %	0 %	0 %	385334158
86	NC_017509	GTT	2	6	2885	2890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334158
87	NC_017509	TAA	2	6	2892	2897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334158
88	NC_017509	A	6	6	2909	2914	100 %	0 %	0 %	0 %	385334158
89	NC_017509	TGG	2	6	2944	2949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334158
90	NC_017509	GGA	2	6	2990	2995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334158
91	NC_017509	A	6	6	3128	3133	100 %	0 %	0 %	0 %	385334158
92	NC_017509	TAGT	2	8	3162	3169	25 %	50 %	25 %	0 %	385334158
93	NC_017509	A	7	7	3183	3189	100 %	0 %	0 %	0 %	385334158
94	NC_017509	A	6	6	3215	3220	100 %	0 %	0 %	0 %	385334158
95	NC_017509	T	7	7	3227	3233	0 %	100 %	0 %	0 %	385334158
96	NC_017509	ATT	2	6	3245	3250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334158
97	NC_017509	ACA	2	6	3251	3256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334158
98	NC_017509	TTC	2	6	3279	3284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385334158
99	NC_017509	CAA	2	6	3320	3325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334158
100	NC_017509	AAT	2	6	3344	3349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334158
101	NC_017509	CTT	2	6	3411	3416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385334158
102	NC_017509	AGG	2	6	3441	3446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334158
103	NC_017509	TATAA	2	10	3458	3467	60 %	40 %	0 %	0 %	385334158
104	NC_017509	TTTC	2	8	3471	3478	0 %	75 %	0 %	25 %	385334158
105	NC_017509	A	7	7	3496	3502	100 %	0 %	0 %	0 %	385334158
106	NC_017509	ACA	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334158
107	NC_017509	CCA	2	6	3664	3669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385334158
108	NC_017509	A	6	6	3691	3696	100 %	0 %	0 %	0 %	385334158
109	NC_017509	ATG	2	6	3822	3827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334158
110	NC_017509	TTGAA	2	10	3840	3849	40 %	40 %	20 %	0 %	385334158
111	NC_017509	A	7	7	3848	3854	100 %	0 %	0 %	0 %	385334158
112	NC_017509	A	6	6	3866	3871	100 %	0 %	0 %	0 %	385334158
113	NC_017509	GAA	2	6	3920	3925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334158
114	NC_017509	A	6	6	3980	3985	100 %	0 %	0 %	0 %	385334158
115	NC_017509	ATG	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334158
116	NC_017509	TGA	2	6	4030	4035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334158
117	NC_017509	A	6	6	4166	4171	100 %	0 %	0 %	0 %	385334158
118	NC_017509	CAAAG	2	10	4186	4195	60 %	0 %	20 %	20 %	385334158
119	NC_017509	A	7	7	4264	4270	100 %	0 %	0 %	0 %	385334158
120	NC_017509	AATT	2	8	4302	4309	50 %	50 %	0 %	0 %	385334158
121	NC_017509	GAT	2	6	4426	4431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334158
122	NC_017509	TCA	2	6	4490	4495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334158
123	NC_017509	GTG	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334158
124	NC_017509	CTG	2	6	4569	4574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334158
125	NC_017509	AAT	2	6	4647	4652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334159
126	NC_017509	A	6	6	4693	4698	100 %	0 %	0 %	0 %	385334159
127	NC_017509	TAA	2	6	4704	4709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334159
128	NC_017509	A	7	7	4780	4786	100 %	0 %	0 %	0 %	385334159
129	NC_017509	A	6	6	4811	4816	100 %	0 %	0 %	0 %	385334159
130	NC_017509	TGA	2	6	4938	4943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334159
131	NC_017509	AATT	2	8	4946	4953	50 %	50 %	0 %	0 %	385334159
132	NC_017509	T	6	6	4977	4982	0 %	100 %	0 %	0 %	385334159
133	NC_017509	ACC	2	6	5078	5083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385334159
134	NC_017509	A	7	7	5093	5099	100 %	0 %	0 %	0 %	385334159
135	NC_017509	GAAAA	2	10	5110	5119	80 %	0 %	20 %	0 %	385334160
136	NC_017509	A	6	6	5116	5121	100 %	0 %	0 %	0 %	385334160
137	NC_017509	A	6	6	5127	5132	100 %	0 %	0 %	0 %	385334160
138	NC_017509	ATA	2	6	5157	5162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334160
139	NC_017509	TCA	2	6	5173	5178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334160
140	NC_017509	CAA	2	6	5210	5215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334160
141	NC_017509	T	8	8	5259	5266	0 %	100 %	0 %	0 %	385334160
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